SZTE Info

DNS-szekvenáló berendezés a TTIK Biokémiai és Molekuláris Biológiai Tanszéken

Jól vizsgázik a DNS-szekvenáló berendezések új nemzedékének képviselője a TTIK Biokémiai és Molekuláris Biológiai Tanszéken.

Cikk nyomtatásCikk nyomtatás
Link küldésLink küldés

Megtalálni egy szalmaszálat a szénakazalban


Az emberi örökítő anyagot (DNS) 3 000 000 000-nál több A, C, G és T betűkkel jelölt építőegység alkotja. Az építőegységek hosszabb-rövidebb sorozatai a gének, melyek működése meghatározza tulajdonságainkat. A hárommilliárd DNS-építőegység sorrendjében egyes emberek között átlagosan 3 millió helyen van eltérés és változások életünk során is létrejönnek. Ezeknek leggyakrabban nincs észrevehető következménye, más esetekben viszont az öröklött változatok meghatározzák hajlamainkat egyes megbetegedésekre és a létrejött változások szó szerint élet és halál közötti különbség okai lehetnek. Az örökítő anyag pontos szerkezetének megismerése ezért nagyon fontos öröklődő betegségek és megbetegedési hajlamok felismeréséhez, egyes betegségtípusok esetében pedig a már kialakult megbetegedés kezelésére alkalmas eljárások kidolgozásához. A DNS szerkezetének meghatározására, azaz az építőegységek pontos sorrendjének - szekvenciájának - leírására alkalmas módszerek és eszközök az utóbbi években rendkívül sokat fejlődtek. Az erre alkalmas modern berendezések a komputer- és nanotechnológiai megoldásokat molekuláris biológiai eredményekkel összegezve képesek az örökítő anyag jellemzését rendkívül hatékonyan megvalósítani. Szükség is van a nagy teljesítményre, mert apró eltéréseket azonosítani a genetikai információ nagy halmazában óriási kihívás; mintha szalmaszálakat kellene szénakazalban megtalálni. A kutatók várakozása, hogy az erre alkalmas az eszközökkel végezett vizsgálatok eredményei elvezetnek majd az ún. személyre szabott orvoslási módszerek kidolgozásához. Ezt akkor érjük majd el, ha a beteg genetikai öröksége és egészségi állapota ismeretében kaphat hatékony, de káros mellékhatásokat nem okozó kezelést.


A TTIK Biokémiai és Molekuláris Biológiai Tanszéken most végeznek próbakísérleteket világviszonylatban is az egyik legmodernebb DNS szerkezetkutatásra alkalmas berendezéssel. Az eszköz beszerzésére az Európai Unió nyújtott 200 ezer euro támogatást magyar-román együttműködési program keretében. A készülék a DNS molekula egyik lánca alapján több száz lépésen át építi fel a másikat, négy eltérő színnel megjelölt építőegységet használva. A nanogramm mennyiségű anyaggal végzett láncépítés automatizálva, egy üvegfelületen, négyzetmilliméterenként több százezer ponton történik. A készülék minden építőegység hozzáadása után színes fényképet készít a folyamatról, ami alapján a komputere összeállítja a DNS-t alkotó egységek millióinak sorrendjét.


Egy 20 órás folyamatban az eszköz összeillesztette a bélbaktérium teljes DNS sorrendjét és azonosította, hogy a vizsgált minta 11 ponton mutat eltérést az adatbázisban nyilvántartott 4 356 236 egységből álló baktérium DNS-től. Ami nem meglepő, mert az eltérések többségét pontosan a baktériumot vizsgáló kutatók hozták létre, hogy hatásukat vizsgálják.


Egy másik analízisben Dr. Bodai László a tanszék munkatársa olyan emberi gének szerkezetét vizsgálta az eszközzel, amelyekről a világ számos laboratóriumában gyűjtik az adatokat, hogy kimutassák megváltozásaik milyen szerepet játszanak daganatok kialakulásában. A vizsgálat 94 ún. „rák-gént” jellemezett egyetlen kísérletben. Az eredmény kimutatta, hogy a mintaként használt sejtekben számos változás van ezekben a génekben. A génváltozatok egy csoportjáról ismert, hogy az emberek egy részében előfordulnak, más génváltozatok csak a vizsgált sejtek jellemzői. Nagyszámú hasonló analízis vezethet el azoknak a változatoknak az azonosítására, amelyek a daganatok terjedésében is szerepet játszanak.


A baktérium és rákos sejtek genetikai állományának vizsgálata korántsem jelenti teljes kihasználását az új DNS-szekvenáló berendezés adta lehetőségeknek. Segítségével sok további analízis-típus végezhető, amelyekkel a gének szerkezetén kívül, azok működésébe is betekintést nyerhetünk. Ez segíthet kórokozók gyors azonosításában, rokonsági kapcsolatok elemzésében, állat és növénynemesítésben és számos további, változatos célkitűzésekkel végzett vizsgálatban. A Biokémiai és Molekuláris Biológiai Tanszéken létrehozott Genom analízis laboratórium lehetőséget teremt ilyen analízisek végzésére az egyetem egységeiben folyó projektek számára.


További információ:

Prof. Dr. Boros Imre

Biokémiai és Molekuláris Biológiai Tanszék

borosi@bio.u-szeged.hu


Támogatók:

A Biokémiai és Molekuláris Biológiai Tanszéken folyó kutatás a TÁMOP-4.2.4.A/2-11/1-2012-0001 Nemzeti Kiválóság Program című kiemelt projektben, részben az Európai Unió támogatásával, az Európai Szociális Alap társfinanszírozásával valósul meg.

Cikk nyomtatásCikk nyomtatás
Link küldésLink küldés

SZTEmagazin

2017. október 03.

Kiemelt_Antalicz_B

Első díjat nyert az Országos Tudományos Diákköri Konferencián, és egyedül épített a lézerfényt mérni képes szenzort. Felsőfokon beszél németül, angolul olvas szakcikkeket, miközben kínaiul tanul. A kollégiumában segíti az önképzőkör munkáját, s emellett egy új kutatási projekthez számítógépes szoftvert ír. Ő Antalicz Balázs, a Szegedi Tudományegyetem MSc-képzéses fizika szakos hallgatója, akitől leckét kaptunk lendületből és szakmai elhivatottságból.

SZTEtelevízió

2017. szeptember 13.

kiemelt_tanevnyito2017

Olyan jelentős fejlesztések előtt áll az SZTE, amelyekkel nemzetközi rangú kutatóegyetemmé válik – jelentette ki a rektor, igazolta példákkal a kormányt képviselő igazságügyi miniszter. A Szegedi Tudományegyetem 2017-2018-as tanévet nyitó ünnepségéről készült rövid videó itt megtekinthető.

Eseménynaptár

Eseménynaptár RSS

Rendezvénynaptár *

  • október 5. 09:00 - 22. 19:00
    A kiállítás szervezője: SZAB Művészeti Szakbizottság.
  • október 6. 08:00 - december 20. 08:00
    A szegedi szecessziós épületeket szokatlan szemszögbôl mutatja meg a tárlat. Az épületekre jellemzô szecessziós részleteket láthatjuk viszont fotókon. Olyan perspektívából, madártávlatból, ahogy az utca embere nem láthatja ôket. A kiállítás megtekinthetô december 20-ig.
  • október 7. 14:00 - november 10. 08:00
    A Magyar Alkotómûvészek Országos Egyesületével karöltve, szalonjelleggel a MAOE teljes képzômûvészeti tagságát megszólaltató tárlatot mutat be a REÖK. Ennek a kiállításnak a korábbi években különbözô, nagyhírû intézmények, mint például a szentendrei MûvészetMalom adott helyet. Az eddigi évek tapasztalatai alapján a szegedi kiállítóházba is 6-800 mûvész alkotását várjuk. A kiállítás megtekinthetô november 10-ig. Belépôjegy 500 Ft.
  • október 9. 15:00 - november 10. 20:00
    A fényképeket a szerző Juhász Antalnak az 1960-as évek óta végzett néprajzi terepmunkáin készítette. Az idő tájt a tanyai emberek a gazdasági, társadalmi változások időszakát élték. Évtizedek múltán látjuk, hogy a felvételek többnyire egy még paraszti életformában élt nemzedék hétköznapi munkáját, ünnepeit dokumentálják.
  • október 9. 18:00 - 21. 20:00
    Megnyitja: Bene Zoltán író, a Szeged folyóirat fôszerkesztôje Közremûködik: Csanádi Hajnalka (ének), Nemes Levente (doromb, dob) Nagy Károly (Szeged, 1952) Vinkler-díjas festô- és grafikusmûvész, a „Szeged kultúrájáért díj” 2017. évi kitüntetettje. A szegedi Tanárképzô Fôiskolán földrajz-rajz szakos tanári diplomát szerzett, majd elvégezte a Képzômûvészeti Fôiskola továbbképzô kurzusát. Tanított általános iskolákban (Algyô, Deszk), az Eötvös Gimnáziumban és mûvészeti iskolákban (Lyra, Classic) rajz és vizuális kultúra tantárgyat, médiaismeretet. A Szegedi Szépmíves Céh szabadiskolájában rajzot, festészetet és fotózást oktat. 1990 óta vezet nyári mûvésztelepeket. Fest olajjal és akrillal, készít akvarellt, ecsetrajzot, hagyományos sokszorosító grafikával és computer grafikával is foglalkozik. Elnöke a Szegedi Szépmíves Céhnek, tagja a Magyar Rajztanárok Országos Egyesületének. Megtekinthetô október 21-ig, hétköznapokon 08.00–22.00, szombaton 09.00–20.00 óráig.